MSN Messenger 6.0和QQ 2003都有丰富的聊天表情图标，从样式上来看MSN Messenger 6.0要更丰富一些，而且MSN Messenger 6.0还支持自己定义新的表情图标。
QQ秀是腾讯以前推出的功能，但对于用户的吸引力一直不大，在QQ 2003版本中得到了最大的发挥，可以想见QQ秀商城将又是腾讯的商机之一。

功能：

QQ 2003和MSN Messenger 6.0都支持增强文字聊天，可以定义文字大小、颜色和添加表情。QQ以往不支持多人聊天，因此在QQ此前的版本中加入了组的功能，在QQ 2003中，除了支持组之外，还加入了在两人对话中邀请他们参与多人聊天的功能，而此前MSN Messenger一直就支持此功能。另外，QQ 2003和MSN Messenger 6.0都支持语言聊天和视频聊天的功能。
对短信的支持是QQ一直以来的赢利的武器，最新的QQ 2003中，对短信的支持更为强大。增加了专用的短信按钮，自写短信分条发送等功能。而MSN Messenger 6.0也有对移动通讯工具的支持，但在中国范围内还无法使用。

文件传输：

文件传输是即时通讯中用户经常使用的功能，在MSN Messenger以前的版本中，接受到的文件只能放到一个固定的目录，在最新的MSN Messenger 6.0，用户可以自己选择每一个传输文件的存放地址，并且可以突破防火墙的限制进行文件传输。
QQ 2003则在新版本中加入对文件断点续传的支持，这使得网络条件不太好的用户大大收益，而MSN Messenger 并不支持断点续传。

MSN Messenger聊天记录

MSN Messenger 6.0最大的改变就是增加了聊天记录的保存功能。在MSN Messenger 以前的版本中一直没有这一功能，由此还有人开发了专门的软件保存其聊天记录。不过在MSN Messenger 6.0必须在个人选项中进行设置后才可以自动保存聊天记录，默认是不支持的。

MSN Messenger聊天背景

在MSN Messenger 6.0，还可以自行修改聊天背景，可以随意选择图片。